第一章至第三章：故事开始于一系列神秘的海上事故，阿龙纳斯教授和他的仆人康塞尔被邀请调查这些事件。他们发现一艘名为“林肯号”的战舰正在追捕一个传说中的“海怪”。

第四章至第六章：在追逐过程中，“林肯号”遭遇袭击，阿龙纳斯教授、康塞尔以及捕鲸手尼德·兰三人不慎落入海中，被神秘的“海怪”救起。

第七章至第十章：他们发现自己身处一艘先进的潜水艇——“鹦鹉螺号”，并结识了船长尼莫。尼莫船长带领他们进行了一次海底漫步，并展示了潜水艇的高科技设备。

第十一章至第十五章：尼莫船长带众人游览了海底世界，包括珊瑚礁、沉船和海底森林。他们还目睹了一场激烈的章鱼攻击，尼德·兰英勇地帮助击退了敌人。

第十六章至第二十章：尼莫船长分享了他的生活哲学，并透露自己对陆地文明的厌恶。他们继续探索深海，发现了丰富的海洋生物和矿产资源。

第二十一章至第二十五章：一行人经历了冰山封路的危险，尼莫船长凭借智慧成功脱困。他们还参观了海底火山，并目睹了壮观的熔岩喷发。

第二十六章至第三十章：尼莫船长讲述了他悲惨的过去，揭示了他对人类社会的复杂情感。众人计划逃离“鹦鹉螺号”，但行动屡遭阻碍。

第三十一章至第三十五章：最终，尼德·兰成功实施了逃脱计划，三人返回陆地。然而，他们的经历让阿龙纳斯教授对海洋有了更深的理解和敬畏。

三十六章至四十章：故事以阿龙纳斯教授的反思结束，他将这段经历记录下来，希望人们能更加珍惜和保护海洋环境。

整部小说不仅描绘了惊险刺激的冒险旅程，还蕴含着对科学、人性和社会的深刻思考，堪称经典之作。